SCoPE2，进阶的单细胞蛋白质组方法揭露吞噬细胞蛋白质组异质性
得益于单细胞转录组学，现在具有不同表型的异质群体细胞类型的组织体已可以清晰识别。诚然，单一细胞分化经常出现自蛋白介导的生理反应，对于不同翻译修饰的理解依然有限。目前主流基于单细胞转录组测序技术对于许多样本存在低采样率，导致数字化mRNA计数器准确度差，由此可知，蛋白质丰度估算也不可靠。
巨噬细胞是天然免疫细胞并具有不同功能和分子表型，对一系列疾病都很重要，包括肿瘤。由于上面提到的测序技术局限性，在单细胞蛋白质组学领域却发现存在大量未被发现的机理。
这里，Specht et al 使用多元LC-ESI-MS/MS（包括采用欧若拉纳升色谱柱）进行单细胞蛋白质组学研究，进一步优化了他们早期的SCoPE-MS方法形成SCoPE2。这大大地提升了定量准确性和分析通量，通过自动化微型样本前处理装置减少手动操作时间，极大地降低了成本。
分析均一单核细胞分化成为类吞噬细胞中异质性的出现，启用该方法使得在10天的机时内完成鉴定了1490个不同类型的单细胞。
此外，数据表明甚至当分化源自暴露于同一环境的均一单核细胞，跨越一个连续活动周期蛋白质组阶段时吞噬细胞蛋白质组也发现了异质性，这与此前发现存在细胞因子时出现的一种偏振轴有关。
这些数据可以实现临床应用，比如一定疾病范围的生物靶标发现和进行基于蛋白质网络功能的直接因果机制推断。更多的细胞和蛋白质变体的定量分析，在此方向研究时假定设想将会更少。
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贾罗德·桑道博士评注
